Przedsiębiorstwo posiada także nowoczesne laboratorium chemiczno - biologiczne, do którego zadań należy:
- badanie i kontrola jakości wody dostarczanej odbiorcom z terenu miasta i gmin ościennych w każdej fazie jej uzdatniania i przesyłu,
- badanie i kontrola jakości ścieków surowych odprowadzanych do kanalizacji miejskiej, uzdatnianych i ścieków oczyszczonych, odprowadzanych do wody powierzchniowej,
- analiza składu osadów ściekowych wytwarzanych w procesie oczyszczania ścieków.
Zadania te laboratorium wykonuje na rzecz przedsiębiorstwa jako własne jak również na zlecenie innych podmiotów gospodarczych i osób fizycznych.
Laboratorium działa w dwóch profilach: 
1. laboratorium biologiczne z pracowniami:
- bakteriologiczną,
- hydrobiologiczną,
2. laboratorium fizyko-chemiczne z pracowniami:
- oznaczeń miareczkowych,
- oznaczeń kolorymetrycznych i wagowych,
- absorpcji atomowej,
- chromatografii gazowej.
Podstawą zapewnienia wymaganej jakości wody jest kontrola jej parametrów fizyko-chemicznych, bakteriologicznych i organoleptycznych, zarówno na wyjściu z Zakładu Produkcji Wody jak i w sieci rozdzielczej, a także bezpośrednio u odbiorców.
Zakres analityczny laboratorium był od roku 1992 sukcesywnie rozszerzany i obecnie obejmuje 86 parametrów, w tym mikrozanieczyszczenia (46 parametrów) takie jak:
-
pestycydy,
-
chlorowcopochodne węglowodorów nasyconych (w tym THM-y),
-
wielopierścieniowe węglowodory aromatyczne (WWA),
-
substancje powierzchniowo czynne,
-
metale ciężkie.
Stała kontrola laboratoryjna jakości przesyłanej wody oraz zrzucanych ścieków zapewnia spełnienie wymogów norm jakościowych i ochrony środowiska.
